Nach der Zufuhr von eiweißhaltigen Lebensmitteln beginnt die Verdauung des Eiweiß imMagen. Dort werden mit Hilfe von Salzsäure (HC1) aus den Belegzellen der Magenschleimhaut die Raumstrukturen der Proteine aufgebrochen und die Pepsine aus den Hauptzellen aktiviert, die bereits große Eiweiß Moleküle teilen.

Die weitere Verdauung erfolgt über Aufspaltung durch Enzyme aus der Bauchspeicheldrüse mit Trypsin, Chymotrypsin, Carboxypeptidase und Enzymen aus der Darmschleimhaut Aminopeptidase.
Die endgültige Zerlegung der Protein Peptide in die einzelnen Aminosäuren geschieht in der Dünndarmschleimhaut durch Enzyme Dipeptidasen. Die Aminosäuren gelangen durch die Dünndarmwandzellen in die Blutbahn und von dort in die Leber.